В 1785 году береговой оползень разрушил Борисоглебскую и Зачатьевскую башню, которые по велению Екатерины II были разобраны и заменены на невысокие крепостные стены. В 1833 году стены переложили и около Борисоглебской башни был обустроен «Духовской пролаз» – небольшие ворота, по бокам от которых находились сторожевые помещения.
В 1966 году в рамках раскопок и реставрационных работ на территории кремля был найден каменный остов Борисоглебской башни. На месте старой, началось строительство новой башни, архитектором сооружения выступил Святослав Агафонов. Строительные работы завершились в 1974 году.
Реконструкция внутренней планировки и расчеты высоты и размеров новой Борисоглебской башни соответствуют остальным круглым башням Нижегородского кремля.